ドラゴンクエスト３に所謂「強くてニューゲーム」のような機能は存在しない。強さに関わるやりこみとしては、転職を繰り返して強いキャラクターを作るくらいのことしかできない。しかし、クリア後の特典として、オリジナルのファミコン版には無かったやりこみ要素が存在する。
やりこみ要素
謎の洞窟・ゼニスの城
エンディングを見て「ロト」の称号を得た冒険の書でプレイを再開すると、竜の女王の城 から謎の洞窟というダンジョンに入ることができる。この先にあるゼニスの城にいる詩人から情報を聞くと追加アイテムを入手できる機会が得られる。
謎の塔
また、ゼニスの城の先にある謎の塔の最奥では、本編の最終ボスを凌駕する強さを持つ裏ボスと戦うことが可能で、そのボスに打ち勝つと特別な願いを聞いてもらうことができるという。