フォールアウト4では、メインクエスト中のプレイヤーの行動や選択によってエンディングの内容は変化しない。どの組織に所属してゲームをクリアしたかによって、エンディングのカットシーンに多少の変化が生じるだけにとどまる。 具体的には、ミニッツメン・B.O.S.・レールロード・インスティチュートのいずれのメインクエストを進めてクリアしたかによってエンディング冒頭のカットシーンとナレーションが変化する。しかし、後続するカットシーンとナレーションは共通である。